TELİF KİTAPLAR:

• Bilim Tarihine Giriş, (Sevim Tekeli, Esin Kâhya, Melek Dosay Gökdoğan, Hüseyin Gazi Topdemir, Yavuz Unat ve Ayten Koç Aydın ile birlikte), Ankara 1999, 451 s.
• Türk Aydınlanması ve Voltaire, Geleneksel Düşünceden Kopuş, Ankara 1999, 211 s.
• Takiyüddîn’de Matematik ve Astronomi, Ankara 2000, 243 s.
• Osmanlılar’da Bilimsel Düşüncenin Yapısı, Ankara 2001, 96 s.
• Bilim Tarihi Kılavuzu, Buluşlar ve Yapıtlar, (Melek Dosay Gökdoğan, Hüseyin Gazi Topdemir, Yavuz Unat, İnan Kalaycıoğulları ve Yasemin Emlü ile birlikte), Ankara 2001, 340 s.
• Türkiye’de Bilim Tarihi Araştırmalarının Dünü ve Bugünü, Ankara Üniversitesi Dil ve Tarih-Coğrafya Fakültesi, Bilim Tarihi Anabilim Dalı’nda Yapılan Çalışmalar, (Esin Kâhya, Melek Dosay Gökdoğan, Hüseyin Gazi Topdemir ve Yavuz Unat ile birlikte), Ankara 2003, 171 s.
• Philosophia Ottomanica, Osmanlı İmparatorluğu Dönemi’nde Türk Felsefesi, Eski Felsefe, Cilt 1, Ankara 2005, 233 s.
• Philosophia Ottomanica, Osmanlı İmparatorluğu Dönemi’nde Türk Felsefesi, Eski İle Yeni Felsefe Arasında, Cilt 2, Ankara 2005, 240 s.
• Philosophia Ottomanica, Osmanlı İmparatorluğu Dönemi’nde Türk Felsefesi, Yeni Felsefe, Cilt 3, Ankara 2007, 256 s.
• Dil ve Tarih-Coğrafya Fakültesi ve Türkiye’de Beşerî Bilimlerin Yeniden İnşası, Elli Portre, (Doğan Atılgan ile birlikte), Ankara 2008.

ÇEVİRİ KİTAPLAR:

• Bursalı Mehmed Tâhir Bey ve Türklerin Ulûm ve Fünûna Hizmetleri, (Yavuz Unat ile birlikte yapılmış ayrıntılı bir araştırma ile birlikte), Ankara 1995, 106 s.
• George Sarton, Antik Bilim ve Modern Uygarlık (Ancient Science and Modern Civilization, Nebraska 1954), (Melek Dosay Gökdoğan ile birlikte), Ankara 1995, 150 s.
• Şemseddin Sâmî, Medeniyyet-i İslâmiyye, Ankara 1996, 109 s.
• Mustafa Sâmî Efendi, Avrupa Risâlesi, Ankara 1996, 60 s.
• Ahmed Cevdet Paşa, Takvîmü’l-Edvâr (Takvimler), (Yavuz Unat ile yapılmış ayrıntılı bir araştırma ile birlikte), Ankara 1996, 88 s.
• Rızaeddin ibn Fahreddin, İslâm Filozofu İbn Rüşd, Ankara 1997,  72 s.
• George Sarton, Bilim Tarihinde Yöntem, (Melek Dosay Gökdoğan, Yavuz Unat ve Güldeniz Can ile birlikte), Ankara 1997, 133 s.
• Şemseddin Sâmî, İslâmiyetin Yayılması İçin Yapılan Çalışmalar (Himmetü’l-Humâm fî Neşri’l-İslâm), Ankara 1997, 46 s.
• Hakim Muhammed Said, İslâm Bilim ve Felsefesine Giriş (Personalities Noble, Glimpses of Renowned Scientists and Thinkers of Müslim Era), Ankara 1999, 78 s.
• Abdülhak Adnan Adıvar, Denemeler, “Bilimin Sarp Yolunda Cüretkâr Adımlar”, (Abdülhak Adnan Adıvar’ın Türk bilim ve düşünce tarihindeki yerini tartışan bir “Sunuş” ile yazarın yaşamını ve yapıtlarını tanıtan “Kronolojik Biyografi” ile birlikte), Ankara 2003, 207
• Sâlih Zeki, Âsâr-ı Bâkiye, Ortaçağ İslâm Dünyası’nda Trigonometri, (Yavuz Unat ile birlikte), Ankara 2003, 210 s.
• Sâlih Zeki, Âsâr-ı Bâkiye, Bilginlerin Yaşamları ve Yapıtları, (Melek Dosay Gökdoğan ve Mutlu Kılıç ile birlikte), Ankara 2004, 212 s.

MAKALE:

• “Takiyüddin’in Ağabeyi Necmüddin ibn Maruf ve Onun ‘Cedâvilu li-Ma’rifeti Ru‘yeti Ehilleti’ş-Şuhûr’ Adlı Risâlesi”, Bilim ve Felsefe Metinleri, Cilt 1, Sayı 1, Ankara 1992, s. 9-29.
•  “Eski Bir Hesap Aleti: Rubu’l-Müceyyeb ve Takiyüddin ibn Maruf’un ‘Rubu’l-Müceyyeble Yapılan İşlemler Manzûmesi’ Adlı Risâlesi”, Bilim ve Felsefe Metinleri, Cilt 1, Sayı 1, Ankara 1992, s. 29-55.
•  “Bedreddin Sıbt el-Mârdînî’nin ‘Mukaddime fî Hisâbi’l-Mesâili’l-Ceybiyye ve’l-‘Amâli’l-Felekiyye’ Adlı Risâlesi”, Bilim ve Felsefe Metinleri, Cilt 1, Sayı 1, Ankara 1992, s. 55-67.
•  “Takiyüddin’in Farklı Büyüklükte Sonsuz Nicelikler Meselesine Trigonometriden Getirmiş Olduğu Bir Örnek”, Ankara Üniversitesi, Dil ve Tarih-Coğrafya Fakültesi, Araştırma Dergisi, Cilt XIV, Ankara 1992, s. 91-96.
• “I. Mahmud’a Hediye Edilen İki Otomatın Tanıtımı Maksadıyla Kaleme Alınmış Küçük Bir Risâle”, Bilim ve Felsefe Metinleri, Cilt 1, Sayı 2, Ankara 1992, s. 117-129.
•  “İstanbul Rasathanesi’nde Yapılmış Olan Gözlemler”, Belleten, Cilt LVII, Sayı 218, Ankara 1993, s. 161-172.
• “İsmail Gelenbevî’nin Üçgenlerin Kenarları Adlı Risâlesi”, Erdem, Cilt 9, Sayı 25, Mayıs 1996, s. 175-222.
• “Takiyüddin’in Ondalık Kesirleri Trigonometri ve Astronomiye Uygulaması”, Bilim ve Teknik, Sayı 351, Şubat 1997, s. 36
•  “Bilim Tarihinde Metin Çalışmalarının Önemi”, (Melek Dosay Gökdoğan ile birlikte), Bilim, Bilim Politikası ve Üniversiteler, Yayına Hazırlayanlar: Emine Akalın, Hakan Aydoğdu ve Reşat Saraoğlu, İstanbul 1997, s. 101-108.
• “Ahmet Cevdet Paşa’nın Önerdiği Yeni Bir Takvim”, (Yavuz Unat ile birlikte),  Belleten, Cilt LXI, Sayı 230, Ankara 1997, s. 111-120.
• “Bilim ve Felsefe Tarihi Kurumu”, Cumhuriyet Bilim-Teknik, 28 Şubat 1998, Sayı: 571, s. 15.
•  “Târîh-i Hind-i Garbî’de Hint Okyanusu, Kızıldeniz ve Süveyş Kanalı İle İlgili Düşünceler”, (Mutlu Kılıç ile birlikte), Osmanlı, Editör: Güler Eren, Ankara 1999, s. 355-371.
• “Takîyüddîn’in Cerîde el-Dürer ve Harîde el-Fiker Adlı Yapıtında Bulunan Onluk Trigonometrik Cetveller (Düzenleniş ve Kullanılışları)”, Osmanlı, Editör: Güler Eren, Ankara 1999, s. 399-410.
• “Melhameler ve Bir On Yedinci Yüzyıl Osmanlı Âlim ve Edîbi Cevrî Çelebi’nin Melhame’si”, Osmanlı, Editör: Güler Eren, Ankara 1999, s. 431-441.
• “Takiyüddin ibn Maruf’un Ondalık Kesirleri Trigonometri ve Astronomiye Uygulaması”, Ankara Üniversitesi, İlâhiyat Fakültesi Dergisi, Prof. Dr. Necati Öner Armağanı, Cilt 40, Ankara 1999, s. 403-424.
• “Hoca Tahsîn Efendi ve Felsefe İle İlgili Bir Şiiri”, (Âdem Akın ile birlikte), Nüsha, Yıl 1, Sayı 1, Ankara 2001, s. 72-79.
• “Unutulmuş Bir Osmanlı Düşünürü Hoca Tahsîn Efendi’nin Târîh-i Tekvîn Yâhûd Hilkat Adlı Eseri ve Haeckelci Evrimciliğin Türkiye’ye Girişi”, (Bilal Yurtoğlu ile birlikte), Nüsha, Yıl 1, Sayı 2, Ankara 2001, s. 166-196.
•  “Münîf Paşa’nın Bilimlerin Değeri ve Çeşitlerine İlişkin İki Makalesi”, (Âdem Akın ile birlikte), Düşünen Siyaset (Bilim Tarihi), Sayı 16, Ankara 2002, s. 187-207.
• “Ali Kuşçu ve el-Muhammediyye, el-Fethiyye ve Risâle fî Hall Eşkâl el-Mu‘addil li’l-Mesîr Adlı Eserlerinin Türk Bilim Tarihindeki Yeri”, (Yavuz Unat ile birlikte), Düşünen Siyaset (Bilim Tarihi), Sayı 16, Ankara 2002, s. 231-255.
• “Cevâhirnâmeler ve Osmanlılar Dönemi’nde Yazılmış İki Cevâhirnâme”, (Mutlu Kılıç ile birlikte), Ankara Üniversitesi, Osmanlı Tarihi Araştırma ve Uygulama Merkezi Dergisi (OTAM), Sayı 14, Ankara 2003, s. 1-64.  
• “Türkiye’de Bilim Tarihi Araştırmalarının Gelişimine Genel Bir Bakış (1532-1993)”, Türkiye’de Bilim Tarihi Araştırmalarının Dünü ve Bugünü, Ankara Üniversitesi Dil ve Tarih-Coğrafya Fakültesi, Bilim Tarihi Anabilim Dalı’nda Yapılan Çalışmalar, Ankara 2003, s. 1-92.
•  “Ankara Üniversitesi, Dil ve Tarih-Coğrafya Fakültesi’nde Bilim Tarihi Araştırmalarının Başlaması ve Gelişmesi (Kronolojik Bir Bakış)”, (Melek Dosay Gökdoğan ile birlikte), Türkiye’de Bilim Tarihi Araştırmalarının Dünü ve Bugünü, Ankara Üniversitesi Dil ve Tarih-Coğrafya Fakültesi, Bilim Tarihi Anabilim Dalı’nda Yapılan Çalışmalar, Ankara 2003, s. 93-109.
•  “Bilim Tarihi ve Cumhuriyet Dönemi’ndeki Bilimsel Çalışmalar”, Türkiye’de Bilim Tarihi Araştırmalarının Dünü ve Bugünü, Ankara Üniversitesi Dil ve Tarih-Coğrafya Fakültesi, Bilim Tarihi Anabilim Dalı’nda Yapılan Çalışmalar, Ankara 2003, s. 111-117.
• “Ankara Üniversitesi, Dil ve Tarih Coğrafya Fakültesi, Felsefe Bölümü, Bilim Tarihi Anabilim Dalı’nda Yetişen Araştırmacılar (Özgeçmişleri ve Yayınları), (Esin Kâhya, Melek Dosay Gökdoğan, Hüseyin Gazi Topdemir ve Yavuz Unat ile birlikte), Türkiye’de Bilim Tarihi Araştırmalarının Dünü ve Bugünü, Ankara Üniversitesi Dil ve Tarih-Coğrafya Fakültesi Bilim Tarihi Anabilim Dalı’nda Yapılan Çalışmalar, Ankara 2003, s. 118-171.
• “Türkiye’de Artık Bir Bilim Tarihi Bölümü Kurulmalıdır…!”, Bilim ve Ütopya, Sayı 121, Temmuz 2004, s. 48-51.
• “Çağdaş Matematiğin Türkiye’ye Girişi (Halifezâde İsmâ‘îl Efendi’den Sâlih Zeki Bey’e Kadar Yapılan Çalışmalara Genel Bir Bakış”, Salih Zeki, Âsâr-ı Bâkiye, Bilginlerin Yaşamları ve Yapıtları, Cilt 3, Yayına Hazırlayanlar: Melek Dosay Gökdoğan, Remzi Demir ve Mutlu Kılıç, Ankara 2004, s. 1-45.
• “Sâlih Zeki Bey (1864-1921), Hayatı-Eserleri ve Türk Bilim Hayatındaki Yeri”, Salih Zeki, Âsâr-ı Bâkiye, Bilginlerin Yaşamları ve Yapıtları, Cilt 3, Yayına Hazırlayanlar: Melek Dosay Gökdoğan, Remzi Demir ve Mutlu Kılıç, Ankara 2004, s. 48-68.
• “Saçaklızâde Muhammed ibn Ebî Bekr el-Mar‘aşî ve Tertîb el-‘Ulûm Adlı Eseri”, (Âdem Akın ile birlikte), Ankara Üniversitesi, Osmanlı Tarihi Araştırma ve Uygulama Merkezi Dergisi (OTAM), Sayı 16, Ankara 2004, s. 1-64.
• “Sâlih Zeki Bey (1864-1921), Hayatı-Eserleri ve Türk Bilim Hayatındaki Yeri”, Bilim ve Ütopya, Sayı 122, Ağustos 2004, s. 44-49.
• “İlim ve Scientia”, Bilim ve Ütopya, Sayı 125, Kasım 2004, s. 52-56.
• “Büyük Bir Matematik Tarihçisi ve Felsefecisi: Sâlih Zeki Bey (1864-1921)”, (İnan Kalaycıoğulları ile birlikte), Kutadgubilig, Sayı 6, İstanbul 2004, s. 195-211.
• “Osmanlılar Dönemi’nde Bilim Tarihi Yazıcılığına Genel Bir Bakış ve Ahmed Râsim’in Terakkiyyât-ı ‘İlmiyye ve Medeniyye Adlı Eseri”, (İnan Kalaycıoğulları ile birlikte), Türkiye Araştırmaları Literatür Dergisi (Türk Bilim Tarihi), Cilt 2, Sayı 4, İstanbul 2004, s. 595-627.
• “Bizans İmparatorluğu’nun Yıkılış ve Osmanlı İmparatorluğu’nun Kuruluş Sürecinde (1300-1453) Rumlar’da Bilim ve Felsefeye Kronolojik Bir Bakış”, (Melek Dosay Gökdoğan ile birlikte), Bilim ve Ütopya, Sayı 128, Şubat 2005, s. 58-62.
• “Ahmed Vefîk Paşa’nın Hikmet-i Târîh Adlı Eseri”, (Bilal Yurtoğlu ile birlikte), Kutadgubilig, Sayı 7, İstanbul 2005.
• “Takiyyüddîn ve Stevin’de Ondalık Kesirler”, Bilim ve Ütopya, Sayı 134, Ağustos 2005, s. 37-41.
• “Memlûkler’de Bilim”, Bilim ve Ütopya, Sayı 136, Ekim 2005, s. 34-40.
• “Subhi Edhem Bey’in Bilim Tarihi ve Bilim Felsefesi Bilinci”, Bilim ve Ütopya, Sayı 139, Ocak 2006, s. 52-57.
• “Subhi Edhem Bey’in ‘İlm-i Nebâtât Târîhi”, I. Ulusal Veteriner Hekimliği Tarihi ve Meslekî Etik Sempozyumu Bildirileri, 30 Mart - 1 Nisan 2006, (Prof. Dr. Ferruh Dinçer’in 70’inci Yaşı Anısına), Editör: Abdullah Özen, Elazığ 2006, s. 133-159.
• “Ömer Hayyâm’ın Felsefî Öğretisi Üzerine Bir Deneme”, Bilim ve Ütopya, Sayı 145, İstanbul 2006, s. 4-10.
• “İlk Bilim Tarihi Kitabımız: Fen Adamları”, Bilim ve Ütopya, Sayı 147, Eylül 2006, s. 41-46.
• “600. Ölüm Yıldönümü’nde İbn Haldûn’un Tarih ve Toplum Felsefesinin Türkiye’ye Girişi ve Etkileri”, Bilim ve Ütopya, Sayı 148, Ekim 2006, s. 9-15.
• “Hint Okyanusu’nda Bir Türk Amirali, Seydî Ali Reîs ve Kitâb el-Muhît fî ‘İlm el-Eflâk ve el-Ebhur”, Bilim ve Ütopya, Sayı 153, Mart 2007, s. 36-44.
•  “Sâlih Zeki Bey’in Matematikle İlgili Küçük Bir Yapıtı: Hârika-ı Hilkât (Yaradılış Harikası)”, İnan Kalaycıoğulları ile birlikte hazırlanan bu çalışma da yakında yayımlanacaktır.

ÇEVİRİ MAKALELER:

• George Sarton, “İbn Sina: Hekim, Bilgin ve Filozof (980-1037)”, (Avicenna: Physician, Scientist and Philosopher, 980-1037, Bull. N.Y. Acad. Med. 31, 1953, s. 307-317), Felsefe Dünyası, Sayı 13, Ankara 1994, s. 78-87.
• “Osmanlı Devleti’nin Kuruluşunun 600. Yıldönümü Münasebetiyle Münîf Paşa Tarafından Yazılan Destân-ı Âl-i ‘Osmân”, (Âdem Akın ile birlikte), Bilge, Cilt 8, Sayı 29, Ankara 2001, s. 25-27.  
• Ernst Haeckel, “Din ve Bilim Bağlantısı Olarak Monizm, Bir Bilim Adamının İnanç Konusundaki İtirafları”, Türkçe’ye Çevirenler: Bahâ Tevfîk ve Ahmed Nebîl, Bir Sunuş İle Yayıma Hazırlayanlar: Remzi Demir ve Bilal Yurtoğlu, Düşünen Siyaset (Bilim Tarihi), Sayı 16, Ankara 2002, s. 259-293.
• “Sâlih Zeki Bey’in Journal Asiatique’de Yayımlanan ‘Notation algébrique chez les Orientaux’ Adlı Makalesi”, Ankara Üniversitesi, Osmanlı Tarihi Araştırma ve Uygulama Merkezi Dergisi (OTAM), Sayı 15, Ankara 2004, s. 333-353.
• “Sâlih Zeki Bey’in ‘İslâm’da Matematiksel Bilimler Tarihi’ Adlı Makalesi, (Ali Rıza Tosun ile birlikte), Ortaçağ İslâm Dünyası’nda Bilim ve Teknik, (Makaleler), Editör: Yavuz Unat, Ankara 2008, s. 15-41.